引起唇腭裂的因素尚未完全明了，但可能与以下因素有关：

　　遗传因素：遗传学研究证明，本病为多基因遗传性疾病，20-30%的患者具有阳性的遗传因素。我们也经常可见在患者的亲属中有类似的畸形发生。

　　营养因素：妇女怀孕期间的呕吐和偏食可影响营养摄入，造成维生素缺乏，在动物实验中，用缺乏维生素A、E的食物喂养怀孕小白鼠时，出生的幼鼠常有唇腭裂发生。

　　病毒感染：在妊娠早期(2个月内)，如遇风疹病毒感染，可能成为婴儿唇腭裂的原因。

　　药物因素：有些药物能通过胎盘屏障影响胚胎发育，如安眠药、抗过敏药、苯妥英那、肾上腺皮质激素、环磷酸胺均可导致胎儿畸形。

　　内分泌影响：实验证明，孕鼠在孕后9天、10天、11天各注射肾上腺皮质激素，其所生育的幼鼠中多患有唇腭裂。因此，在怀孕早期(8周内)，如孕妇因精神紧张及外伤等原因，可使体内的肾上腺皮质激素分泌增加，从而导致婴儿先天畸形。

　　放射线：妊娠早期如果接触放射线，则有可能导致胎儿唇裂腭裂。

　　另外，孕妇吸烟、酗酒等坏习惯，以及食物中缺乏人体必需的叶酸和维生素A、B，也可直接导致新生儿先天性唇腭裂等头颈部畸形。

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